Em 2009 concluiu um documentário sobre o realizador Martin Scorcese e um fresco auto-biográfico de quase sete horas («Lithuania and the Collapse of the USSR»), estreado em Janeiro no Festival de Roterdão.Em paralelo continua a apresentar exposições em grandes museus e cinematecas de todo o mundo e a filmar os amigos no dia-a-dia.
São célebres as suas colaborações com Andy Warhol, Alan Ginsberg, John Lennon, Yoko Ono, Salvador Dali, entre outras figuras de culto.
A sua vitalidade e o seu empreendimento servem de exemplo a sucessivas gerações de cineastas e artistas plásticos.
Mekas fará uma Masterclass na Culturgest a partir de excertos escolhidos dos seus filmes e conversará com o público em várias sessões do festival.
A sua presença em Lisboa é co-organizada pelo Museu Reina Sofia de Madrid, que também o homenageia.

Um estado foi desmembrado e uma nacionalidade devastada para que – no momento actual (e esperemos final)– sete novos estados e sete novas identidades emergissem. O turbilhão ideológico teve lugar não apenas à porta da (assim chamada) Europa civilizada, mas em frente de muitas câmaras, algumas das quais determinadas a gravarem mais do que observações jornalísticas.
A retrospectiva aqui proposta é uma tentativa de reunir múltiplas visões – nem todas políticas e nem todas politicamente correctas – em apenas uma; um exame aos possíveis denominadores comuns ou talvez a diferenças óbvias; a exploração de um inerente conflito político que tragicamente se transformou num conflito étnico; e, por fim, embora igualmente importante, a descoberta de alguns talentos cinematográficos esquecidos, cujo pecado é apenas terem uma visão diferente daquilo que foi (e talvez ainda seja) esperado deles.  
Jurij Meden